RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434353.6

CXorf40A-208, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-208ENST00000434353 B4E171 279 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PPP6CO00743 305 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 OR7A17O14581 309 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 ADRB1P08588 477 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 DHRS4L1P0CG22 281 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CD22P20273 847 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 TSPAN7P41732 249 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CCNG1P51959 295 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 SLC18A1P54219 525 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 REEP5Q00765 189 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 MC2RQ01718 297 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 GPS2Q13227 327 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 NUDCD3Q8IVD9 361 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 EHD1Q9H4M9 534 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 SYNPO2LQ9H987 977 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 IRAK4Q9NWZ3 460 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 RARRES3Q9UL19 164 aa18.08■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 TRBC2A0A5B9 178 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 OR1F1O43749 312 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CTSBP07858 339 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 MSL3P1P0C860 447 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 BCL6P41182 706 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 WDR4P57081 412 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CAMK2BQ13554 666 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CYB5D1Q6P9G0 228 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 OR4N4Q8N0Y3 316 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 KRT78Q8N1N4 520 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 TBC1D19Q8N5T2 526 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 OR1L3Q8NH93 324 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PMEPA1Q969W9 287 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 RNF31Q96EP0 1072 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 WDR34Q96EX3 536 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 OR2A5Q96R48 311 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 EFCAB11Q9BUY7 163 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.07■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 A0A1B0GTL3 188 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 WFS1O76024 890 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 TNFSF15O95150 251 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 OTCP00480 354 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 STATHP02808 62 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 NEFHP12036 1026 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CXCR2P25025 360 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CCR10P46092 362 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 RELAQ04206 551 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 TRAF3Q13114 568 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 TBCCQ15814 346 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PAGE2BQ5JRK9 111 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PPP1R3BQ86XI6 285 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 MDM1Q8TC05 714 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 SERTAD3Q9UJW9 196 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa18.06■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 H0YGG7 62 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 BIRC5O15392 142 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 OR2B3O76000 313 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CLDN9O95484 217 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 MLYCDO95822 493 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 CASP2P42575 452 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 RAB15P59190 212 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PPP2R2AP63151 447 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 PCDH1Q08174 1060 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 LCP2Q13094 533 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 LAPTM5Q13571 262 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 IL11RAQ14626 422 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 DCAF12Q5T6F0 453 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 LIPJQ5W064 366 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 GRHL2Q6ISB3 625 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 GPR135Q8IZ08 494 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 OR4F6Q8NGB9 312 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 USP7Q93009 1102 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 TAAR9Q96RI9 348 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 NTMT1Q9BV86 223 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 NRSN2Q9GZP1 204 aa18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
CXorf40A-208ENST00000434353 MED4Q9NPJ6 270 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms