RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 VPS18Q9P253 973 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 HMGXB4Q9UGU5 601 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 KLHL33A6NCF5 533 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 MYO1FO00160 1098 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 HSF2BPO75031 334 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 HEXAP06865 529 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 Q0VFX4 171 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 RAB41Q5JT25 222 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FCRL6Q6DN72 434 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 MAVSQ7Z434 540 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TTC7BQ86TV6 843 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 LHX9Q9NQ69 397 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRK-211ENST00000429595 OR1A2Q9Y585 309 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRK-211ENST00000429595 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 IRF4Q15306 451 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRK-211ENST00000429595 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 LMO3Q8TAP4 145 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 ARSGQ96EG1 525 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 PDXPQ96GD0 296 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-211ENST00000429595 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.02□□□□□ -1.45
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