RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 PAF1Q8N7H5 531 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SLC35B4Q969S0 331 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 C7orf34Q96L11 122 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 YME1L1Q96TA2 773 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CHST8Q9H2A9 424 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SIAEQ9HAT2 523 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 LTB4R2Q9NPC1 389 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 KLK4Q9Y5K2 254 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 AIREO43918 545 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 GALTP07902 379 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ITGA2P17301 1181 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ITGB6P18564 788 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ALDH9A1P49189 494 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ACLYP53396 1101 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 WNT3P56703 355 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 VLDLRP98155 873 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 IFITM3Q01628 133 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 OR4F3Q6IEY1 312 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZNB5 142 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 USP45Q70EL2 814 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SLC30A8Q8IWU4 369 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 NUDT8Q8WV74 236 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 COL21A1Q96P44 957 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 COPS4Q9BT78 406 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 DOHHQ9BU89 302 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 THSD1Q9NS62 852 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 RAD18Q9NS91 495 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SIRT5Q9NXA8 310 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 FBXO10Q9UK96 956 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 MKLN1Q9UL63 735 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 RNF6Q9Y252 685 aa16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SH3D21A4FU49 640 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CLCA1A8K7I4 914 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 H0YIV9 168 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 TSPAN3O60637 253 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CLDN7O95471 211 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CDK1P06493 297 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 COX7A2P14406 83 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CSKP41240 450 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 UGT8Q16880 541 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 FAM92BQ6ZTR7 304 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 BTLAQ7Z6A9 289 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ENTHD1Q8IYW4 607 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 C10orf111Q8N326 155 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CPXM2Q8N436 756 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJC22Q8N4W6 341 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ECHDC3Q96DC8 303 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SCRN2Q96FV2 425 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 APOLD1Q96LR9 279 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 LRFN2Q9ULH4 789 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 GPR39O43194 453 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 OLFM2O95897 454 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 PTPN2P17706 415 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 TACR1P25103 407 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 S100A5P33763 92 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 DEFA1P59665 94 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 DEFA3P59666 94 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 NCS1P62166 190 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 APH1BQ8WW43 257 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 APIPQ96GX9 242 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 TPT1P8Q9HAU6 139 aa16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms