RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM205Q6UW68 189 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00696Q6ZRV3 163 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PPIL6Q8IXY8 311 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CPNE9Q8IYJ1 553 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 ACTRT1Q8TDG2 376 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CNDP1Q96KN2 507 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PCBD2Q9H0N5 130 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM184CQ9NVA4 438 aa19.92■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 H0YIG0 161 aa19.91■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 P2RX6O15547 441 aa19.91■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 BMP10O95393 424 aa19.91■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa19.91■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 THAP11Q96EK4 314 aa19.91■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF700Q9H0M5 742 aa19.91■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 I3L1I5 382 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 CES2O00748 559 aa19.9■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 C8GP07360 202 aa19.9■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 AVPR1BP47901 424 aa19.9■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 MPP1Q00013 466 aa19.9■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 PCOLCEQ15113 449 aa19.9■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM129AQ9BZQ8 928 aa19.9■□□□□ 0.78
LIMS1-208ENST00000428064 RNF32Q9H0A6 362 aa19.9■□□□□ 0.78
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LIMS1-208ENST00000428064 H7BY64 318 aa19.89■□□□□ 0.77
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LIMS1-208ENST00000428064 CRYMQ14894 314 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 VN1R4Q7Z5H5 301 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CNTN4Q8IWV2 1026 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 BCORP1Q8N888 145 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 MCOLN3Q8TDD5 553 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PRAP1Q96NZ9 151 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 OSBPL9Q96SU4 736 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TUBB6Q9BUF5 446 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TAS2R13Q9NYV9 303 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PTGFRNQ9P2B2 879 aa19.89■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV17A0A0B4J275 112 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 FFAR3O14843 346 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A5O15375 505 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 GPR42O15529 346 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 RGS4P49798 205 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
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LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0408Q6ZU52 694 aa19.88■□□□□ 0.77
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LIMS1-208ENST00000428064 GALNT7Q86SF2 657 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PLD3Q8IV08 490 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 CATSPER1Q8NEC5 780 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 NAT9Q9BTE0 207 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 ABCF3Q9NUQ8 709 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 MKL2Q9ULH7 1088 aa19.88■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 PDE10AQ9Y233 779 aa19.88■□□□□ 0.77
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LIMS1-208ENST00000428064 EFNA3P52797 238 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SPANXN3Q5MJ09 141 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SPNS2Q8IVW8 549 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 OR1N1Q8NGS0 311 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO2A1Q92959 643 aa19.87■□□□□ 0.77
LIMS1-208ENST00000428064 TM4SF19Q96DZ7 209 aa19.87■□□□□ 0.77
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