RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 USP22Q9UPT9 525 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CACNA1EQ15878 2313 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 EI24O14681 340 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 OXA1LQ15070 435 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 CLEC14AQ86T13 490 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 P3H2Q8IVL5 708 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 CD200R1Q8TD46 325 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 DESI1Q6ICB0 168 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 RABL3Q5HYI8 236 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 IER5LQ5T953 404 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 SLC22A9Q8IVM8 553 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 ZBTB2Q8N680 514 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 TMEM159Q96B96 161 aa8.36□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.36□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.35□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 TSPAN6O43657 245 aa8.35□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 IMPDH1P20839 514 aa8.35□□□□□ -1.07
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ACTBP13-201ENST00000423971 PDHA2P29803 388 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 ARHGDIAP52565 204 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 CTSCP53634 463 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 TMBIM6P55061 237 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 APOFQ13790 326 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 SVOPQ8N4V2 548 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTBP13-201ENST00000423971 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.35□□□□□ -1.07
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