RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	ACY1	Q03154	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	OLIG2	Q13516	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	C1orf61	Q13536	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	IHH	Q14623	411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ACAP2	Q15057	778 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	KYNU	Q16719	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	MREG	Q8N565	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	LCN9	Q8WX39	176 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GPR22	Q99680	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234		X6R8D5	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	VCAN	P13611	3396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234		A0A088AWK7	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	URAD	A6NGE7	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CCL22	O00626	93 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PLD2	O14939	933 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68	2e-8	■■■■■ 27.7
PUM2-205	ENST00000420234	OR1I1	O60431	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GLRA3	O75311	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GPC4	O75487	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RASSF9	O75901	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	HAUS5	O94927	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PROS1	P07225	676 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	HBQ1	P09105	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	NUDT17	P0C025	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TPBGL	P0DKB5	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	NEFH	P12036	1026 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CD59	P13987	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	FDXR	P22570	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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