RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 FPR1P21462 350 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 KDELR2P33947 212 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NTHL1P78549 312 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TPGS2Q68CL5 300 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC66Q68CR7 880 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP2U1Q7Z449 544 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT12Q8IV01 421 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZZZ3Q8IYH5 903 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HSH2DQ96JZ2 352 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H2AJQ99878 128 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 H2AFJQ9BTM1 129 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 NOTCH4Q99466 2003 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 TLL1O43897 1013 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CBSLP0DN79 551 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 BMP4P12644 408 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CBSP35520 551 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ST13P50502 369 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 DUOXA1Q1HG43 343 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 CLECL1Q8IZS7 167 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM9CQ8IZT9 166 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 S100ZQ8WXG8 99 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP1-202ENST00000417536 JRKO75564 520 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 EPN2O95208 641 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 AOAHP28039 575 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 GSSP48637 474 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC73Q5JTD7 316 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 DGKKQ5KSL6 1271 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 FRG2Q64ET8 278 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TPD52L3Q96J77 140 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 FRG2BQ96QU4 278 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 BBS2Q9BXC9 721 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ACOT13Q9NPJ3 140 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT20P35900 424 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 DNASE1L3Q13609 305 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 UGT8Q16880 541 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 AHSA2Q719I0 299 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD4AQ8N468 514 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC12A9Q9BXP2 914 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SIRT5Q9NXA8 310 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6KA6Q9UK32 745 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SOCS5O75159 536 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 IGSF6O95976 241 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LRG1P02750 347 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LCKP06239 509 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 COX7A2P14406 83 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINA4P29622 427 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINB10P48595 397 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCR4P61073 352 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CHIT1Q13231 466 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PTOV1Q86YD1 416 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEAL8Q8IYN2 117 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ELMOD1Q8N336 334 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D20Q96BZ9 403 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RY13Q9BPV8 354 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL7BQ9BQE9 202 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM8A1Q9UBU6 413 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TMED5Q9Y3A6 229 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM221A6NGB7 291 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 AGAP14A8MT82 685 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM240Q5SV17 173 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 L3MBTL4Q8NA19 623 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 REEP1Q9H902 201 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVW-1Q9UQF0 538 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 GREM1O60565 184 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LILRB3O75022 631 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3BGRLO75368 114 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSAP10619 480 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A12P48065 614 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPC1P48995 793 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 STK19P49842 368 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms