RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 INHBBP09529 407 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ITPKAP23677 461 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 KDELR2P33947 212 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 STT3AP46977 705 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 DUSP6Q16828 381 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD46Q86W74 232 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 BTN2A2Q8WVV5 523 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 EGLN2Q96KS0 407 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CORO1BQ9BR76 489 aa23■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SLC1A7O00341 560 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 B4GAT1O43505 415 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CATP04040 527 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ENGP17813 658 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 FPR1P21462 350 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 RXRGP48443 463 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ENTPD1P49961 510 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 MEP1AQ16819 746 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 FGD3Q5JSP0 725 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 LAIR2Q6ISS4 152 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 KLHL35Q6PF15 583 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 LINC00299Q6ZSB3 139 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CBLL1Q75N03 491 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 HS3ST5Q8IZT8 346 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 OR56A3Q8NH54 315 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 OTUB2Q96DC9 234 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 BBS2Q9BXC9 721 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 LHPPQ9H008 270 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ABCG8Q9H221 673 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PREBQ9HCU5 417 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 TBCCD1Q9NVR7 557 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 GALNT8Q9NY28 637 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 MARK1Q9P0L2 795 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.99■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 JUNDP17535 347 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CCR3P51677 355 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 HYAL1Q12794 435 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 XKR6Q5GH73 641 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 KDM4DQ6B0I6 523 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 DPPA4Q7L190 304 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 NRSN1Q8IZ57 195 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 FRS2Q8WU20 508 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SLC5A10A0PJK1 596 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.98■■□□□ 1.27
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PMS1-205ENST00000409985 HTR1AP08908 422 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 COX7A2P14406 83 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 IL7RP16871 459 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 GJA1P17302 382 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CD22P20273 847 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 IGFBP5P24593 272 aa22.98■■□□□ 1.27
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PMS1-205ENST00000409985 SPIDRQ14159 915 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 DOC2AQ14183 400 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ACOX1Q15067 660 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ZNF284Q2VY69 593 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
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PMS1-205ENST00000409985 NODALQ96S42 347 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 CD84Q9UIB8 345 aa22.98■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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PMS1-205ENST00000409985 ATG13O75143 517 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 FABP3P05413 133 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 TIMP2P16035 220 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PRLHRP49683 370 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G16P53816 162 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SPIN4Q56A73 249 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 SCAMP4Q969E2 229 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 TMEM159Q96B96 161 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.97■■□□□ 1.27
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D23Q9NUY8 699 aa22.97■■□□□ 1.27
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