RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GSTA4O15217 222 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KMOO15229 486 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PI15O43692 258 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM23O75077 832 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO1DO94832 1006 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TGFB1P01137 390 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MT-ND1P03886 318 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FUCA1P04066 466 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KELP23276 732 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPH2P23942 346 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR1EP28566 365 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CCR3P51677 355 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP4F3Q08477 520 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR4Q13639 388 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TCEA2Q15560 299 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATS1Q496A3 300 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRR23BQ6ZRT6 265 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PDZD3Q86UT5 571 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TDHQ8IZJ6 230 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DTWD1Q8N5C7 304 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF740Q8NDX6 193 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CATSPER1Q8NEC5 780 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2T12Q8NG77 320 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC5A11Q8WWX8 675 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FIG4Q92562 907 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 BIRC7Q96CA5 298 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NSMCE2Q96MF7 247 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF583Q96ND8 569 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 INPP5KQ9BT40 448 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC17A9Q9BYT1 436 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 VCXQ9H320 206 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RMND5AQ9H871 391 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 BATF3Q9NR55 127 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNK6Q9Y257 313 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 INVSQ9Y283 1065 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DOCK9Q9BZ29 2069 aa3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 A0A1W2PQF6 199 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SERTM1A2A2V5 107 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RFXANKO14593 260 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GBAP04062 536 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC35G4P0C7Q5 338 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 COX7A2P14406 83 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPS1L1P21108 318 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HRH2P25021 359 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FASP25445 335 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM23P36406 574 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKN2CP42773 168 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KIR3DL1P43629 444 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RPA4Q13156 261 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RUNDC3AQ59EK9 446 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 METRNLQ641Q3 311 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NXPE4Q6UWF7 544 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PROSER1Q86XN7 944 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM126BQ8IUX1 230 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.83□□□□□ -1.8
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