RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 SERPINA3P01011 423 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 IFNA7P01567 189 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CAP1Q01518 475 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXL18Q96ME1 805 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1W2PRQ8 180 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 APODP05090 189 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FPR1P21462 350 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 GKP32189 559 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 HYAL2Q12891 473 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 KLHL26Q53HC5 615 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SYN3O14994 580 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OR1I1O60431 355 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FOXM1Q08050 763 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 KCNAB2Q13303 367 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ADAM15Q13444 863 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.82□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM72CH0Y354 149 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 B3GALT2O43825 422 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF823P16415 610 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CD72P21854 359 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 IL12BP29460 328 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 JAG1P78504 1218 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM72BQ86X60 149 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TAC3Q9UHF0 121 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SCGB1D2O95969 90 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ACP5P13686 325 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PPM1AP35813 382 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF130Q86XS8 419 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 DPAGT1Q9H3H5 408 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CDH7Q9ULB5 785 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PEAK1Q9H792 1746 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SNED1Q8TER0 1413 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 A8MUA0 341 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TAS2R50P59544 299 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MAB21L1Q13394 359 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ASB12Q8WXK4 309 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TM9SF2Q99805 663 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TREM1Q9NP99 234 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RDH8Q9NYR8 311 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CLDN4O14493 209 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PI15O43692 258 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CEACAM7Q14002 265 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SMPDL3BQ92485 455 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A1W2PRU2 124 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 KELP23276 732 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MAGEA12P43365 314 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB15P59190 212 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 VITQ6UXI7 678 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NAXEQ8NCW5 288 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.81□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 NDUFS4O43181 175 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PIGRP01833 764 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF3P17036 446 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MAP3K8P41279 467 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MVKQ03426 396 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 PTGR1Q14914 329 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXO27Q8NI29 283 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB8BQ92930 207 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 MYH8P13535 1937 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 SDHDO14521 159 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 STOMP27105 288 aa14.8□□□□□ -0.04
PTGFRN-201ENST00000393203 DGKGP49619 791 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms