RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CXCR2P25025 360 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 GCAP28676 217 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC6A12P48065 614 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 GLRBP48167 497 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNC1P48547 511 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 MUM1Q2TAK8 710 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 NEIL2Q969S2 332 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR78Q96P69 363 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PELI2Q9HAT8 420 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CUTCQ9NTM9 273 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB21Q9UL25 225 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GX78 115 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBC2A0A5B9 178 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 K7ENP7 123 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 UBXN8O00124 270 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP2K7O14733 419 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CLGNO14967 610 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 EFSO43281 561 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 KATNA1O75449 491 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 RFPL1O75677 317 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDT17P0C025 328 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 GMPRP36959 345 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 HSPA7P48741 367 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CXADRP78310 365 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC16Q13042 620 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 DNASE1L3Q13609 305 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PDK4Q16654 411 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA9Q16795 377 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR155Q7Z3F1 870 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SNX31Q8N9S9 440 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CT55Q8WUE5 264 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF31Q96EP0 1072 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CD244Q9BZW8 370 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CHST8Q9H2A9 424 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NDOR1Q9UHB4 597 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TBK1Q9UHD2 729 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 DSCR3O14972 297 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TAPBPO15533 448 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NRP2O60462 931 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM24O75264 130 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 RECKO95980 971 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SHBGP04278 402 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PRB1P04280 392 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT15P19012 456 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 GDF5P43026 501 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PLD3Q8IV08 490 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT78Q8N1N4 520 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MVB12AQ96EY5 273 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 GBP5Q96PP8 586 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SARGQ9BW04 601 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 EHD1Q9H4M9 534 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms