RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CEP19Q96LK0 163 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF583Q96ND8 569 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CASD1Q96PB1 797 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KLQ9UEF7 1012 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NME7Q9Y5B8 376 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TET1Q8NFU7 2136 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MYLKQ15746 1914 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RGS14O43566 566 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CCNDBP1O95273 360 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FTH1P02794 183 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MT-ND1P03886 318 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DQB2P05538 268 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FYNP06241 537 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MTHFD2P13995 350 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ALOX12P18054 663 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN8P19075 237 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FPR1P21462 350 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 AGXTP21549 392 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LMO2P25791 158 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CCR1P32246 355 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 BMPR1AP36894 532 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HNF4AP41235 474 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC15A1P46059 708 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HTR3AP46098 478 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GABREP78334 506 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ABRQ12979 859 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC13A2Q13183 592 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.291e-7■■□□□ 12.7
CTPS1-201ENST00000372616 DGCR6Q14129 220 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MLC1Q15049 377 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SNX20Q7Z614 316 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RAB43Q86YS6 212 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 METTL4Q8N3J2 472 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO30Q8TB52 745 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 EXT2Q93063 718 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NCLNQ969V3 563 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PYURFQ96I23 114 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RNF38Q9H0F5 515 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ASIC5Q9NY37 505 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OPTCQ9UBM4 332 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RNF6Q9Y252 685 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 INVSQ9Y283 1065 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 V9GYQ6 96 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 A0A075B6Q4 140 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 H7C4K7 107 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC28A1O00337 649 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NOBOXO60393 691 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 VPS26AO75436 327 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CREG1O75629 220 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KCNK2O95069 426 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MFN2O95140 757 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OAZ2O95190 189 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OTCP00480 354 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 EPXP11678 715 aa6.97□□□□□ -1.29
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