RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 OR8K3Q8NH51 312 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D15Q8TC07 691 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KIFAP3Q92845 792 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RFT1Q96AA3 541 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NEDD4LQ96PU5 975 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FRG2BQ96QU4 278 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GAD1Q99259 594 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FEVQ99581 238 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CALHM2Q9HA72 323 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PCDH18Q9HCL0 1135 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ABCB9Q9NP78 766 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MED4Q9NPJ6 270 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EQTNQ9NQ60 294 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SENP1Q9P0U3 644 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 WNT16Q9UBV4 365 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FZD4Q9ULV1 537 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK6Q9Y257 313 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IFT52Q9Y366 437 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CHST2Q9Y4C5 530 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MYH2Q9UKX2 1941 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC171Q6TFL3 1326 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MSH6P52701 1360 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OR14I1A6ND48 311 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 H0Y8G0 127 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SAP30O75446 220 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFS3O75489 264 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 WNT11O96014 354 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 AK1P00568 194 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KRT6AP02538 564 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KRT7P08729 469 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PKMP14618 531 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 S1PR1P21453 382 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MSR1P21757 451 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADRA1DP25100 572 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP2.41□□□□□ -2.023e-7■□□□□ 11
CCSAP-202ENST00000366686 DCKP27707 260 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GJB2P29033 226 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CD40LGP29965 261 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FEN1P39748 380 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CRKLP46109 303 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 QARSP47897 775 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 STARP49675 285 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CLCN4P51793 760 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CNN1P51911 297 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 AP1S2P56377 157 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC18A2Q05940 514 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PDIA5Q14554 519 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IL13RA2Q14627 380 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GRIK4Q16099 956 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNMB1Q16558 191 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LY6KQ17RY6 165 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KIF19Q2TAC6 998 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS36Q5K4E3 855 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ATF7IP2Q5U623 682 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CACHD1Q5VU97 1274 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TAPT1Q6NXT6 567 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ATG14Q6ZNE5 492 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PEX13Q92968 403 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC45Q96CN5 670 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PGM2Q96G03 612 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HRASLS5Q96KN8 279 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KRT12Q99456 494 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 VCX3BQ9H321 246 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HHATLQ9HCP6 504 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ALKBH4Q9NXW9 302 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM17Q9Y577 477 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 IL16Q14005 1332 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC7Q96M83 1385 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SMCO3A2RU48 225 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM191CA6NGB0 347 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SNTNA6NMZ2 147 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 H0YCG3 227 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LATO43561 262 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FAM189A1O60320 539 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LPXNO60711 386 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TTC4O95801 387 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRG2P13727 222 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TNNI3P19429 210 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FCARP24071 287 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NR2F2P24468 414 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HOXA6P31267 233 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FMO4P31512 558 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 BTCP35070 178 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SYKP43405 635 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CDH13P55290 713 aa2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms