RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 HTR1EP28566 365 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SLC7A1P30825 629 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TDGQ13569 410 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 DPY19L1Q2PZI1 675 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 GTDC1Q4AE62 458 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TLDC1Q6P9B6 456 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 KRT78Q8N1N4 520 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OR1E3Q8WZA6 343 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 BMFQ96LC9 184 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PCBD2Q9H0N5 130 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 KCNH6Q9H252 994 aa24.72■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 A0A1W2PPV9 198 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 NCK1P16333 377 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 KRT33BQ14525 404 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 UGT8Q16880 541 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 GRAMD1BQ3KR37 738 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TPRG1LQ5T0D9 272 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OR4F3Q6IEY1 312 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OR7A2PQ8NGA2 310 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CANT1Q8WVQ1 401 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 ITCHQ96J02 903 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CAMK1GQ96NX5 476 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SLC6A13Q9NSD5 602 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SEMA4FO95754 770 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 COX7A2P14406 83 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OR4D2P58180 307 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PHEXP78562 749 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 MTAPQ13126 283 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 TMEM126BQ8IUX1 230 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 DNAJB8Q8NHS0 232 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 WDR92Q96MX6 357 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 OR51B5Q9H339 312 aa24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CLK2-201ENST00000355560 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 PCDH7O60245 1069 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 ERN1O75460 977 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 HTR1BP28222 390 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 PIK3CBP42338 1070 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 RAB28P51157 221 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 CYP4F3Q08477 520 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 TCEA2Q15560 299 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 FXNQ16595 210 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 LRIF1Q5T3J3 769 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 RD3Q7Z3Z2 195 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 INPP5KQ9BT40 448 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 IKZF5Q9H5V7 419 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 XKR8Q9H6D3 395 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 PELI2Q9HAT8 420 aa24.7■■□□□ 1.54
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CLK2-201ENST00000355560 TRIOO75962 3097 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa24.7■■□□□ 1.54
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CLK2-201ENST00000355560 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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CLK2-201ENST00000355560 HKDC1Q2TB90 917 aa24.7■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
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CLK2-201ENST00000355560 ARMCX6Q7L4S7 300 aa24.7■■□□□ 1.54
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CLK2-201ENST00000355560 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa24.7■■□□□ 1.54
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CLK2-201ENST00000355560 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 C21orf58P58505 322 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 SFT2D3Q587I9 215 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 RUNDC3AQ59EK9 446 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 GALNT18Q6P9A2 607 aa24.69■■□□□ 1.54
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CLK2-201ENST00000355560 COMMD6Q7Z4G1 85 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 PDSS2Q86YH6 399 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 STARD8Q92502 1023 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 SH3GL1Q99961 368 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 MVB12BQ9H7P6 319 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 AURKCQ9UQB9 309 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 LRCH1Q9Y2L9 728 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa24.69■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 A0A1W2PPC1 479 aa24.68■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 AKT2P31751 481 aa24.68■■□□□ 1.54
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CLK2-201ENST00000355560 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.68■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa24.68■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 ABHD11Q8NFV4 315 aa24.68■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 OR52E1Q8NGJ3 308 aa24.68■■□□□ 1.54
CLK2-201ENST00000355560 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
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