RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 RHAGQ02094 409 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OVGP1Q12889 678 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TAF5Q15542 800 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PFKFB4Q16877 469 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM35AQ53FP2 167 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SPESP1Q6UW49 350 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TOMM5Q8N4H5 51 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 COPS8Q99627 209 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BIN3Q9NQY0 253 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IL17RBQ9NRM6 502 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DMAC2Q9NW81 257 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 CSF1P09603 554 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 SSTR1P30872 391 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MPIP34949 423 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 LAYNQ6UX15 382 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CEP68Q76N32 757 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 BRD9Q9H8M2 597 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRD-201ENST00000355233 INAVAQ3KP66 663 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SNX20Q7Z614 316 aa4.78□□□□□ -1.64
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