RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343738.10

PKD1P6-201, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting pseudogene 6, humanhuman

BASIC

Gene PKD1P6, Length 4,769 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P6-201ENST00000343738 PCDH1Q08174 1060 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 LRP8Q14114 963 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 NUDT13Q86X67 352 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 KCTD7Q96MP8 289 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RMI1Q9H9A7 625 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 TAF1P21675 1872 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 COCHO43405 550 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 CD72P21854 359 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 WASP42768 502 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RTL4Q6ZR62 310 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 VMP1Q96GC9 406 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ALPK1Q96QP1 1244 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 UCK2Q9BZX2 261 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 SLC22A4Q9H015 551 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ZNF30P17039 623 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 NFATC3Q12968 1075 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 SP140Q13342 867 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 MEIOBQ8N635 442 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GINS4Q9BRT9 223 aa20.49■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 PRMT3O60678 531 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ITGB1P05556 798 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 BCHEP06276 602 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 CMPK1P30085 196 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 BDKRB1P46663 353 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 KDELC1Q6UW63 502 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 OR51B5Q9H339 312 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 EHD1Q9H4M9 534 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 IRAK3Q9Y616 596 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 CNMDO75829 334 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 PRSS56P0CW18 603 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 MAGEA3P43357 314 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 MAP2K4P45985 399 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 HTR6P50406 440 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 TMEM203Q969S6 136 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 SOCS5O75159 536 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 DNTTP04053 509 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GJA1P17302 382 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GPX3P22352 226 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 KCNA5P22460 613 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 VIPR1P32241 457 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 OMPP47874 163 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 LIN54Q6MZP7 749 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.48■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 PDYNP01213 254 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GBAP04062 536 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GGT1P19440 569 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 NT5EP21589 574 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GRIA2P42262 883 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 TAS2R50P59544 299 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RAPSNQ13702 412 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 PAGE3Q5JUK9 113 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 MOSPD2Q8NHP6 518 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 H7C0S8 307 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 MT-ND2P03891 347 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 PON2Q15165 354 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 SLC9A5Q14940 896 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 OAFQ86UD1 273 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 ING5Q8WYH8 240 aa20.47■□□□□ 0.87
PKD1P6-201ENST00000343738 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms