RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 COQ10BQ9H8M1 238 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FBRSQ9HAH7 460 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PDLIM1O00151 329 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SPARCP09486 303 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GNRHRP30968 328 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CDKN2BP42772 138 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 KCNQ1P51787 676 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FXYD6P3P58550 94 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 RPS14P62263 151 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GKN2Q86XP6 184 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TCEAL3Q969E4 200 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PGM2Q96G03 612 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SHDQ96IW2 340 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 KCNH6Q9H252 994 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ACSS3Q9H6R3 686 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TLR9Q9NR96 1032 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GRHPRQ9UBQ7 328 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PRQ8 180 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SYN3O14994 580 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 APOL3O95236 402 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SYNGR4O95473 234 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GSTT2BP0CG30 244 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ADH7P40394 386 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FAM92BQ6ZTR7 304 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 USP53Q70EK8 1073 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TFAP2BQ92481 460 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 OTUB2Q96DC9 234 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 LHX5Q9H2C1 402 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FEZF1A0PJY2 475 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 A8MV72 311 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NPIPA2E9PIF3 369 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NPIPA3F8WFD2 350 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 OR2B6P58173 313 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GHRHRQ02643 423 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 DPYSQ14117 519 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 LRRTM4Q86VH4 590 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 HOMEZQ8IX15 550 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CEP76Q8TAP6 659 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SMARCD2Q92925 531 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NINJ1Q92982 152 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NODALQ96S42 347 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CNTN3Q9P232 1028 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 P2RX2Q9UBL9 471 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PEAK1Q9H792 1746 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 B4GALT4O60513 344 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PRKD3O94806 890 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 KAT7O95251 611 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 OR1E2P47887 323 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PREPP48147 710 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 AIF1P55008 147 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FOXK1P85037 733 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 OGDHQ02218 1023 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CMKLR1Q99788 373 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 XKR8Q9H6D3 395 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NANSQ9NR45 359 aa10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 YY2O15391 372 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PI15O43692 258 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GP1BBP13224 206 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 EDN3P14138 238 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 RORCP51449 518 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TIGD6Q17RP2 521 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 PCDH19Q8TAB3 1148 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NSMAFQ92636 917 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TMEM41AQ96HV5 264 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 MAGEH1Q9H213 219 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ZNF358Q9NW07 568 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SEC14L5O43304 696 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 NDST2P52849 883 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GDF10P55107 478 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ST3GAL4Q11206 333 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CPT1BQ92523 772 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SLIT1O75093 1534 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TRAV6A0A075B6T7 132 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 GLTPD2A6NH11 291 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SELENOVP59797 346 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 SYPL2Q5VXT5 272 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 RAET1LQ5VY80 246 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TEX19Q8NA77 164 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 C1orf109Q9NX04 203 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 CALML5Q9NZT1 146 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLN8-201ENST00000331222 TMEM233B4DJY2 109 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms