RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 OR4N4Q8N0Y3 316 aa25.61■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 LRFN5Q96NI6 719 aa25.61■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 SMC6Q96SB8 1091 aa25.61■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 DPH1Q9BZG8 443 aa25.61■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 MKS1Q9NXB0 559 aa25.61■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 SRPK3Q9UPE1 567 aa25.61■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 ACACBO00763 2458 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 FRYQ5TBA9 3013 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 TRBC2A0A5B9 178 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 RRP8O43159 456 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 NTRK1P04629 796 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 CCNYL3P0C7X3 344 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3CGP48736 1102 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 TMPRSS11BQ86T26 416 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PROSER1Q86XN7 944 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 NLGN4XQ8N0W4 816 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 ESX1Q8N693 406 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 CLIP3Q96DZ5 547 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 NDC1Q9BTX1 674 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 ASB1Q9Y576 335 aa25.6■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 FEZF1A0PJY2 475 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 FITM1A5D6W6 292 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 KATNA1O75449 491 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 ATP1A2P50993 1020 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PCDH1Q08174 1060 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 CASP8Q14790 479 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PLD3Q8IV08 490 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 SLC22A9Q8IVM8 553 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 KRT78Q8N1N4 520 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 TEX9Q8N6V9 391 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 BANPQ8N9N5 519 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 KCNE4Q8WWG9 221 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC126Q96EE4 140 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PGM2Q96G03 612 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 RUFY1Q96T51 708 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 NLNQ9BYT8 704 aa25.59■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 IGF2RP11717 2491 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 OR1F1O43749 312 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 CTSBP07858 339 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 CASP2P42575 452 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 EMP3P54852 163 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 NFKB2Q00653 900 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 LAPTM5Q13571 262 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 TBCCQ15814 346 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 XKR6Q5GH73 641 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 MFSD9Q8NBP5 474 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 GALNT6Q8NCL4 622 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 WDR34Q96EX3 536 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 APOPT1Q96IL0 206 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 CENPHQ9H3R5 247 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 EMCNQ9ULC0 261 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PADI1Q9ULC6 663 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa25.58■■□□□ 1.69
CRIP1-201ENST00000330233 A8MT66 165 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 E2F3O00716 465 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 PLIN3O60664 434 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 RAD1O60671 282 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 PROCP04070 461 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 MYZAPP0CAP1 466 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 REEP5Q00765 189 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 IRF8Q02556 426 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 GTF2H2Q13888 395 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 MANEAQ5SRI9 462 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 RHBDD2Q6NTF9 364 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 CSNK1A1LQ8N752 337 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 RDH11Q8TC12 318 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 NKD1Q969G9 470 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 EFCAB11Q9BUY7 163 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 NT5DC2Q9H857 520 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 STARD5Q9NSY2 213 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 MID2Q9UJV3 735 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 PLLPQ9Y342 182 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 FREM2Q5SZK8 3169 aa25.57■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 HYKKA2RU49 373 aa25.56■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.56■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 TAF4O00268 1085 aa25.56■■□□□ 1.68
CRIP1-201ENST00000330233 DLX3O60479 287 aa25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms