RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 CIPCQ9C0C6 399 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.28□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF195O14628 629 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFA2O43678 99 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 SNAP29O95721 258 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 PGGT1BP53609 377 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC66Q68CR7 880 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 CES5AQ6NT32 575 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 LAYNQ6UX15 382 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 RBFAQ8N0V3 343 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 OR8K3Q8NH51 312 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 PROX1Q92786 737 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 CNDP1Q96KN2 507 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 S1PR5Q9H228 398 aa14.27□□□□□ -0.12
HOXA3-201ENST00000317201 TRAV6A0A075B6T7 132 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 RFXAPO00287 272 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 EI24O14681 340 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 LINC01565O15544 149 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ABCB7O75027 752 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 TSC22D2O75157 780 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 IL7RP16871 459 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 CYP2A7P20853 494 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ACRV1P26436 265 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 RHDQ02161 417 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 PTSQ03393 145 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM65Q6PI78 240 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 PIM3Q86V86 326 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 PNPLA1Q8N8W4 532 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 PJA1Q8NG27 643 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 OR4M1Q8NGD0 313 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 TESCQ96BS2 214 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ULK4Q96C45 1275 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 DSN1Q9H410 356 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 BAG5Q9UL15 447 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 COL4A3Q01955 1670 aa14.27□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 LEFTY1O75610 366 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 HSPA4LO95757 839 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 TFEBP19484 476 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 VIPR1P32241 457 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 SOX11P35716 441 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 DCDC1P59894 354 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 CD83Q01151 205 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 NOXA1Q86UR1 476 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 TMIEQ8NEW7 156 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 KIAA1191Q96A73 305 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ASB8Q9H765 288 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 BNIP3LO60238 219 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ITGB6P18564 788 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 NCS1P62166 190 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 PRKAA1Q13131 559 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 RUNX3Q13761 415 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 DGUOKQ16854 277 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 OR4M2Q8NGB6 313 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 FANK1Q8TC84 345 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 CLEC1BQ9P126 229 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.26□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 DNAJB5O75953 348 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 PRNPP04156 253 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 LHCGRP22888 699 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 SLC6A11P48066 632 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 ARSIQ5FYB1 569 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.25□□□□□ -0.13
HOXA3-201ENST00000317201 SFRP1Q8N474 314 aa14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms