RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 FGF18O76093 207 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 EPN2O95208 641 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 PRPS1L1P21108 318 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 HPCAL1P37235 193 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TRPC1P48995 793 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 WNT3P56703 355 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TTC23LQ6PF05 361 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 Q6ZVU0 165 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 CHST14Q8NCH0 376 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 LMLNQ96KR4 655 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 APOL4Q9BPW4 351 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 KRT84Q9NSB2 600 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 VPS4AQ9UN37 437 aa20.32■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MAGEB17A8MXT2 336 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 CCL16O15467 120 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM20BO75063 409 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 COX7A2P14406 83 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ITGB8P26012 769 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 CCR2P41597 374 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 HNMTP50135 292 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 NCS1P62166 190 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TAMM41Q96BW9 452 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 FAM8A1Q9UBU6 413 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM247A6NEH6 219 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 YY2O15391 372 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SCN2BO60939 215 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SEMG1P04279 462 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 GPX2P18283 190 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 HOMEZQ8IX15 550 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 VMP1Q96GC9 406 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 TPD52L3Q96J77 140 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SIRT5Q9NXA8 310 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa20.31■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 NUAK1O60285 661 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 JRKO75564 520 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 C1SP09871 688 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ACRP10323 421 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 KRT20P35900 424 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 HTRA3P83110 453 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 OXA1LQ15070 435 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.3■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 RGS10O43665 173 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 CD22P20273 847 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPN5P54829 565 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 CXCR4P61073 352 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 IFITM3Q01628 133 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MROQ9BYG7 248 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ZBP1Q9H171 429 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ASAH2Q9NR71 780 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 MAFFQ9ULX9 164 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 KRBA1A5PL33 1030 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 GRM6O15303 877 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ADAM23O75077 832 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SH3BGRLO75368 114 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 NUDT7P0C024 238 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 LAMP1P11279 417 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 JUPP14923 745 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SPINT3P49223 89 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 PFN3P60673 137 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 IRF8Q02556 426 aa20.29■□□□□ 0.84
PTDSS2-201ENST00000308020 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms