RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 NFKB2Q00653 900 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 RELAQ04206 551 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 XKR6Q5GH73 641 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 OR2A5Q96R48 311 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SYNPO2LQ9H987 977 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SLC17A7Q9P2U7 560 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 APC2O95996 2303 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 G3V2L1 256 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 AGPSO00116 658 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 OR1F1O43749 312 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 STK17BO94768 372 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0754O94854 1291 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 NTRK1P04629 796 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CPA3P15088 417 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PIK3CGP48736 1102 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 IRF8Q02556 426 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CHIT1Q13231 466 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TCTE1Q5JU00 501 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 WASHC2DQ5SRD0 308 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ATG9BQ674R7 924 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TBC1D19Q8N5T2 526 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 RDH11Q8TC12 318 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 MID2Q9UJV3 735 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PCTPQ9UKL6 214 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 FER1L5A0AVI2 2057 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TRBC2A0A5B9 178 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 H3BMH7 237 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF749O43361 778 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TYROBPO43914 113 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 KATNA1O75449 491 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 BCL6P41182 706 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 HERVK_113P63132 956 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 REEP5Q00765 189 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 DOC2AQ14183 400 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZFAND4Q86XD8 727 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PPP4R1Q8TF05 950 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC126Q96EE4 140 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM237Q96Q45 408 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ERVK-6Q9BXR3 956 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 IPPKQ9H8X2 491 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ACSS2Q9NR19 701 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SCN3AQ9NY46 2000 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 STMND1H3BQB6 276 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF4O60810 478 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SUPT7LO94864 414 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 STATHP02808 62 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CXCR2P25025 360 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CD82P27701 267 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PRKAA2P54646 552 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF678Q5SXM1 525 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 FGF11Q92914 225 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ATP6V1E2Q96A05 226 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 EHD1Q9H4M9 534 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 KCNK9Q9NPC2 374 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 COPG2Q9UBF2 871 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 DKK4Q9UBT3 224 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 IMPDH1P20839 514 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CDH13P55290 713 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 GRM7Q14831 915 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 KRT78Q8N1N4 520 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms