RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298068.9

HECTD2-201, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HECTD2, Length 4,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD2-201ENST00000298068 BEST1O76090 585 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ZNF432O94892 652 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 INHAP05111 366 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PPP3R1P63098 170 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 GPRC6AQ5T6X5 926 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 METTL21AQ8WXB1 218 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ZUFSPQ96AP4 578 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CRELD1Q96HD1 420 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ALPK1Q96QP1 1244 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 FIZ1Q96SL8 496 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SYT17Q9BSW7 474 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 MARK1Q9P0L2 795 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa13.13□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PSMD9O00233 223 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SLC35E2BP0CK96 405 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PIK3CBP42338 1070 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SEMA3AQ14563 771 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TLR1Q15399 786 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 MYLK3Q32MK0 819 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 Q6ZVL8 140 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 NPAS3Q8IXF0 933 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ZNF676Q8N7Q3 588 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 UCK2Q9BZX2 261 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 WDR26Q9H7D7 661 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ST14Q9Y5Y6 855 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 DFNA5O60443 496 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CDRT1O95170 752 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 F2P00734 622 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ACSL1P33121 698 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 RAB8AP61006 207 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 RPS13P62277 151 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 VLDLRP98155 873 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 GPR17Q13304 367 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 GFOD2Q3B7J2 385 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 FBXO43Q4G163 708 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 BRAT1Q6PJG6 821 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 OR8H3Q8N146 312 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SUN5Q8TC36 379 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 GRHL3Q8TE85 626 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CCM2Q9BSQ5 444 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TAPBPLQ9BX59 468 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 BAIAP2Q9UQB8 552 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 RNF6Q9Y252 685 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TMED5Q9Y3A6 229 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 DUOX1Q9NRD9 1551 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 KIF1AQ12756 1690 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 A0A0J9YVX5 310 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ZNF823P16415 610 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 S100GP29377 79 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 OR1E2P47887 323 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PREPP48147 710 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ACADVLP49748 655 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PIGFQ07326 219 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SUSD1Q6UWL2 747 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 STX12Q86Y82 276 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 KXD1Q9BQD3 176 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TMEM248Q9NWD8 314 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ASB3Q9Y575 518 aa13.12□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TFPTP0C1Z6 253 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ATF6P18850 670 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CLCN7P51798 805 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 PHC1P78364 1004 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 EIPR1Q53HC9 387 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 EMC10Q5UCC4 262 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CEP97Q8IW35 865 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SLC30A8Q8IWU4 369 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 RAB8BQ92930 207 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TMED9Q9BVK6 235 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 KCNA5P22460 613 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 ACVR2AP27037 513 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 CRHR2Q13324 411 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TECRLQ5HYJ1 363 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 SYCE2Q6PIF2 218 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TMEM135Q86UB9 458 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TP53INP2Q8IXH6 220 aa13.11□□□□□ -0.31
HECTD2-201ENST00000298068 TCEANCQ8N8B7 351 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms