RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285896.10

CNOT8-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-201ENST00000285896 TRIM23P36406 574 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 KCNJ8Q15842 424 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 IER5LQ5T953 404 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 AMZ2Q86W34 360 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CYGBQ8WWM9 190 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 MED8Q96G25 268 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SLC22A3O75751 556 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CAPN3P20807 821 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 IDUAP35475 653 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 HMGCS1Q01581 520 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 IMPG1Q17R60 797 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 C6orf183Q5T699 404 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 DHFR2Q86XF0 187 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TEX37Q96LM6 180 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CSF3RQ99062 836 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 MROQ9BYG7 248 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SCML1Q9UN30 329 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SNX6Q9UNH7 406 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 UFM1P61960 85 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CHIT1Q13231 466 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.95□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3EA0A087X179 549 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3LB9A6J9 549 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ANGPT2O15123 496 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CLOCKO15516 846 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 MBTPS2O43462 519 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PRAMEF4O60810 478 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CLPXO76031 633 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 BCL10O95999 233 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ASGR2P07307 311 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3HP0C7X1 549 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SLC2A4P14672 509 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ACADLP28330 430 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RCVRNP35243 200 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RPA4Q13156 261 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RCAN2Q14206 197 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RETREG3Q86VR2 466 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 OR56A3Q8NH54 315 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TSPEARQ8WU66 669 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ROPN1LQ96C74 230 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TPK1Q9H3S4 243 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 COL4A2P08572 1712 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 ACOX3O15254 700 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 UGDHO60701 494 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 PDYNP01213 254 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 GPR89BP0CG08 455 aa14.94□□□□□ -0.02
CNOT8-201ENST00000285896 G6PDP11413 515 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms