RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 CLPXO76031 633 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEA11P43364 429 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.55■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GDF5P43026 501 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SEC13P55735 322 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PRMT3O60678 531 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 KCNC3Q14003 757 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF404Q494X3 552 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MEMO1Q9Y316 297 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PRQ8 180 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT6P53370 316 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.881e-7■■□□□ 11.4
CCSAP-201ENST00000284617 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TOR3AQ9H497 397 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GGT5P36269 586 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ARSFP54793 590 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GPR68Q15743 365 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF527Q8NB42 609 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OR5T3Q8NGG3 340 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf74Q96LT6 269 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ALPK1Q96QP1 1244 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF382Q96SR6 550 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TAC3Q9UHF0 121 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MGAT4AQ9UM21 535 aa20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 METTL21EPA6NDL7 271 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 FAM170BA6NMN3 283 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT12Q8WYK0 555 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF639Q9UID6 485 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PIRO00625 290 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K8P41279 467 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF234Q14588 700 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZVU0 165 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CEP76Q8TAP6 659 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TUBA1CQ9BQE3 449 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ITIH1P19827 911 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CLCNKAP51800 687 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TXNDC8Q6A555 127 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 APOC1P02654 83 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 YES1P07947 543 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MC1RQ01726 317 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MOGSQ13724 837 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC66Q68CR7 880 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ULK3Q6PHR2 472 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NDC1Q9BTX1 674 aa20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 F2P00734 622 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RLN2P04090 185 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ECHS1P30084 290 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OR3A3P47888 321 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OR3A2P47893 321 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 KLK6Q92876 244 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 PMEPA1Q969W9 287 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 KCNA7Q96RP8 456 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 H0YAE9 185 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 SCAMP1O15126 338 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6V1G1O75348 118 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CCL14Q16627 93 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 MEP1AQ16819 746 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 ARL9Q6T311 187 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CYS1Q717R9 158 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL20Q96IG2 436 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 RNF6Q9Y252 685 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 TREML1Q86YW5 311 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 OR2L3Q8NG85 312 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 NKD1Q969G9 470 aa20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms