RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265616.9

UBXN8-201, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN8, Length 1,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-201ENST00000265616 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 KDM4DQ6B0I6 523 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FAHD1Q6P587 224 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 TUBA1AQ71U36 451 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 CHPFQ8IZ52 775 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 TTC16Q8NEE8 873 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 OR13H1Q8NG92 308 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 OR2T29Q8NH02 315 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 OR10A6Q8NH74 314 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FAM110BQ8TC76 370 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FIG4Q92562 907 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 NCLNQ969V3 563 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 IGSF21Q96ID5 467 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 EXOC2Q96KP1 924 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 EPYCQ99645 322 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PSD2Q9BQI7 771 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ACPTQ9BZG2 426 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 BAG5Q9UL15 447 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PPT2Q9UMR5 302 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 LAMA3Q16787 3333 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 A0A1W2PPW3 197 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 TSPAN11A1L157 253 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 C9JVG2 144 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 H0YIV9 168 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 J3QW42 95 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 M0R082 166 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 BCKDKO14874 412 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 E2F6O75461 281 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 MYO1DO94832 1006 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FGF19O95750 216 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FTH1P02794 183 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 TCF3P15923 654 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 AMD1P17707 334 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PCMT1P22061 227 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 UGT1A1P22309 533 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 UGT1A4P22310 534 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 IGFBP5P24593 272 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 UGT1A3P35503 534 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 UGT1A5P35504 534 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 HNF1BP35680 557 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 CSKP41240 450 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SGSHP51688 502 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 BMXP51813 675 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SLC35A2P78381 396 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 GPLD1P80108 840 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PLAURQ03405 335 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 RBBP4Q09028 425 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 CDK5R2Q13319 367 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PTGR1Q14914 329 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 CHRNA6Q15825 494 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 NEDD8Q15843 81 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 VMACQ2NL98 169 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FBXO43Q4G163 708 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FRG2Q64ET8 278 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 BRAT1Q6PJG6 821 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SPESP1Q6UW49 350 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FAM151BQ6UXP7 276 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 CBLL1Q75N03 491 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 GJD3Q8N144 294 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 NATD1Q8N6N6 113 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms