RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PEX13	Q92968	403 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SCN2A	Q99250	2005 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	LRBA	P50851	2863 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1B0GUH1	482 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078		E5RI56	91 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	HAT1	O14929	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	VPS26A	O75436	327 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	USP1	O94782	785 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	FKBP9	O95302	570 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINA7	P05543	415 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ANXA5	P08758	320 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SOX11	P35716	441 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	TDGF1P3	P51864	188 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PNLIPRP1	P54315	467 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF33B	Q06732	778 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	RPS6KA1	Q15418	735 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CCNG2	Q16589	344 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ICE2	Q659A1	982 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CASC4	Q6P4E1	433 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CENPU	Q71F23	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	COG1	Q8WTW3	980 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SMPDL3A	Q92484	453 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	NR4A3	Q92570	626 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	HAS2	Q92819	552 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	OR2A5	Q96R48	311 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	IL22	Q9GZX6	179 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	STMN3	Q9NZ72	180 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078		H7BY64	318 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SMAP	O00193	183 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CCL21	O00585	134 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PCDH17	O14917	1159 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ZNHIT1	O43257	154 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	RASAL1	O95294	804 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	BMP10	O95393	424 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SLC16A8	O95907	504 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CXCR5	P32302	372 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SLC26A3	P40879	764 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CTBP1	Q13363	440 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	DSG2	Q14126	1118 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	GBX1	Q14549	363 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PCOLCE	Q15113	449 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SLC34A3	Q8N130	599 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF480	Q8WV37	535 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PHF12	Q96QT6	1004 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	KIFC1	Q9BW19	673 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SOX13	Q9UN79	622 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MYO1C	O00159	1063 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	FGG	P02679	453 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF425	Q6IV72	752 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	NEPRO	Q6NW34	567 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	RELT	Q969Z4	430 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC120	Q96HB5	630 aa		12.79	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms