RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 GMFGO60234 142 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TSPAN3O60637 253 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RFPL3O75679 317 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PTHP01270 115 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GHRHP01286 108 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ASGR2P07307 311 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF688P0C7X2 276 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 G6PDP11413 515 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TIMP2P16035 220 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF823P16415 610 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NR4A1P22736 598 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 COILP38432 576 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GABRB2P47870 512 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TLE1Q04724 770 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GPM6BQ13491 265 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TDGQ13569 410 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RAB33AQ14088 237 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HERC3Q15034 1050 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MOGQ16653 247 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TCTN1Q2MV58 587 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CEACAM21Q3KPI0 293 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 IGSF11Q5DX21 431 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR52E8Q6IFG1 317 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZPBP2Q6X784 338 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 USP53Q70EK8 1073 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF627Q7L945 461 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LSMEM2Q8N112 164 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PPM1KQ8N3J5 372 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR9A2Q8NGT5 310 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KAT2AQ92830 837 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SEMA4DQ92854 862 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MSANTD3Q96H12 275 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TM9SF2Q99805 663 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DPYSL5Q9BPU6 564 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ATG101Q9BSB4 218 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HDAC8Q9BY41 377 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PANK2Q9BZ23 570 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RHBGQ9H310 441 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ANKHQ9HCJ1 492 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZBTB26Q9HCK0 441 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HSPBP1Q9NZL4 362 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC7A11Q9UPY5 501 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LCTP09848 1927 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 AP4M1O00189 453 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DVL1O14640 695 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR2F2O95006 317 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MT-ND2P03891 347 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GLI1P08151 1106 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PNMTP11086 282 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HK1P19367 917 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OGNP20774 298 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MYL9P24844 172 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 FOXN2P32314 431 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 BTDP43251 543 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GPR15P49685 360 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PRMT2P55345 433 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GSCP56915 257 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OSTNP61366 133 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HERV-K104P61576 105 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SH3D19Q5HYK7 790 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ADGRF1Q5T601 910 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TAF2Q6P1X5 1199 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF790Q6PG37 636 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 IL20RBQ6UXL0 311 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PTF1AQ7RTS3 328 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF619Q8N2I2 560 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TTLL6Q8N841 843 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ANKLE1Q8NAG6 615 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KCT2Q8NC54 265 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TSTD1Q8NFU3 115 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR1M1Q8NGA1 313 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR2G2Q8NGZ5 317 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR10A6Q8NH74 314 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 STOML3Q8TAV4 291 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KLHL29Q96CT2 875 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF714Q96N38 554 aa2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms