RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGKQ92643 395 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 KAT2BQ92831 832 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 EXTL1Q92935 676 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ART4Q93070 314 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MOAP1Q96BY2 351 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXL8Q96CD0 374 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF183Q96D59 192 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SNF8Q96H20 258 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 EGLN2Q96KS0 407 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 DACH2Q96NX9 599 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MCEEQ96PE7 176 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP6V0BQ99437 205 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 OSBPL8Q9BZF1 889 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 DCLK3Q9C098 648 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MIS12Q9H081 205 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM107BQ9H098 131 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 LHX5Q9H2C1 402 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CENPHQ9H3R5 247 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MID1IP1Q9NPA3 183 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 COPG2Q9UBF2 871 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MOSPD1Q9UJG1 213 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGA11Q9UKX5 1188 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 C2CD2Q9Y426 696 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A096LPK6 155 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRD1A4D1F6 860 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CGB1A6NKQ9 187 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 DBX1A6NMT0 343 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 LACTBL1A8MY62 500 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 H0YGN5 161 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 H7C1Q1 480 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 M0QYV0 167 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN1O60635 241 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP2C2O75185 946 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 B3GALNT1O75752 331 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 VTNP04004 478 aa4.09□□□□□ -1.75
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CAPNS1-210ENST00000590211 RALAP11233 206 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PDGFRAP16234 1089 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMA2P25787 234 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 HPDP32754 393 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CD86P42081 329 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNJ1P48048 391 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ARSEP51690 589 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ADORA2A-AS1P86434 159 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 IL1RL1Q01638 556 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX1Q13596 522 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGA7Q13683 1181 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PPA1Q15181 289 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 C2CD6Q53TS8 623 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 ESCO2Q56NI9 601 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TFDP3Q5H9I0 405 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 NOTUMQ6P988 496 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 AAGABQ6PD74 315 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 DSG4Q86SJ6 1040 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 RASAL3Q86YV0 1011 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 TMC8Q8IU68 726 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPNS1-210ENST00000590211 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.09□□□□□ -1.75
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