RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR87Q9BY21 358 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 KLQ9UEF7 1012 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.16□□□□□ -0.62
CAPNS1-209ENST00000590049 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.16□□□□□ -0.62
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CAPNS1-209ENST00000590049 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 PRSS38A1L453 326 aa11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 KCNJ13O60928 360 aa11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 SPAG7O75391 227 aa11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 POP7O75817 140 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC166P0CW27 439 aa11.13□□□□□ -0.63
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