RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589934.1

APBA3-204, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-204	ENST00000589934	GSAP	A4D1B5	854 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TMEM233	B4DJY2	109 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934		H0YIV9	168 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	HCRTR1	O43613	425 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	DUX1	O43812	170 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	GFRA3	O60609	400 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CTSV	O60911	334 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	OR4F21	O95013	312 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CLDN9	O95484	217 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CPNE6	O95741	557 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	JUP	P14923	745 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	PVR	P15151	417 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ST6GAL1	P15907	406 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	MAG	P20916	626 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	HRH2	P25021	359 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	MPST	P25325	297 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CMPK1	P30085	196 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	LSP1	P33241	339 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CCNG1	P51959	295 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	IRF8	Q02556	426 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	PRKAA1	Q13131	559 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ILK	Q13418	452 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	BIRC2	Q13490	618 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	AMZ1	Q400G9	498 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	KANK2	Q63ZY3	851 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CGB2	Q6NT52	195 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	LAS2	Q8IYD9	372 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	KCNA7	Q96RP8	456 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	FAM60A	Q9NP50	221 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	PNPO	Q9NVS9	261 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SNX7	Q9UNH6	387 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		12.68	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SERTM1	A2A2V5	107 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TLCD2	A6NGC4	264 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934		H3BMH7	237 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	HAT1	O14929	419 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CLGN	O14967	610 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CCNDBP1	O95273	360 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	HSPA4L	O95757	839 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CAPN1	P07384	714 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	THRA	P10827	490 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	HNF4A	P41235	474 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SCTR	P47872	440 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CCR8	P51685	355 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	XKR6	Q5GH73	641 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	IRGC	Q6NXR0	463 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	MAVS	Q7Z434	540 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	NETO1	Q8TDF5	533 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	USP7	Q93009	1102 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	TGM7	Q96PF1	710 aa		12.67	□□□□□ -0.38
APBA3-204	ENST00000589934	OR2A5	Q96R48	311 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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