RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 UBE4BO95155 1302 aa4.96□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 IL16Q14005 1332 aa4.96□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 MAGEB16A2A368 324 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 C17orf105B2RV13 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC28A1O00337 649 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 GAS8O95995 478 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 GLUD1P00367 558 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 DNAJB1P25685 340 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ADSSP30520 456 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 CDKN1AP38936 164 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 PRPHP41219 470 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 GLUD2P49448 558 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 BNC1Q01954 994 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC3A1Q07837 685 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 DMPKQ09013 629 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 KIF19Q2TAC6 998 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 KLHL10Q6JEL2 608 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SYVN1Q86TM6 617 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM219Q86XT9 240 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 LAX1Q8IWV1 398 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 IPMKQ8NFU5 416 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 PIGBQ92521 554 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 LINGO1Q96FE5 620 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SCMH1Q96GD3 660 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 MAP3K3Q99759 626 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 MTMR12Q9C0I1 747 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 C10orf88Q9H8K7 445 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 VDAC3Q9Y277 283 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 IKBKGQ9Y6K9 419 aa4.95□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 TRAV18A0A075B6X5 111 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 C5orf60A6NFR6 353 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 OR6B1O95007 311 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SKILP12757 684 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SSTR1P30872 391 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ARRB2P32121 409 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ACVRL1P37023 503 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 THOP1P52888 689 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 HUNKP57058 714 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 IRX4P78413 519 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC20A2Q08357 652 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 MYBPHQ13203 477 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 TWIST1Q15672 202 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 EPC2Q52LR7 807 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SPDYCQ5MJ68 293 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF626Q68DY1 528 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 WDR88Q6ZMY6 472 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 MACC1Q6ZN28 852 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 IL17RELQ6ZVW7 336 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 TMEM139Q8IV31 216 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF114Q8NC26 417 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 LEMD2Q8NC56 503 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNH5Q8NCM2 988 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 OR11H4Q8NGC9 324 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 GGHQ92820 318 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM46BQ96A09 425 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 NACAP1Q9BZK3 213 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC39A8Q9C0K1 460 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB17Q9H0T7 212 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 FKRPQ9H9S5 495 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB9BQ9NP90 201 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 TCF7L2Q9NQB0 619 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 PIGVQ9NUD9 493 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 EXOC7Q9UPT5 735 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 KIF3AQ9Y496 699 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 U3KQV3 271 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 A0A1W2PN81 502 aa4.93□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 MACROD2A1Z1Q3 448 aa4.93□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 ANKDD1BA6NHY2 528 aa4.93□□□□□ -1.62
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms