RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 C17orf64Q86WR6 236 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 OR56A3Q8NH54 315 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 KIAA1191Q96A73 305 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 PTERQ96BW5 349 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 TSNARE1Q96NA8 513 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 HAUS8Q9BT25 410 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SGPP1Q9BX95 441 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ALG9Q9H6U8 611 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SNX15Q9NRS6 342 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF358Q9NW07 568 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 DYRK1BQ9Y463 629 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SCN2AQ99250 2005 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 UBXN8O00124 270 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1F1O43749 312 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SUPT3HO75486 399 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 CREG1O75629 220 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR47O94967 919 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SERPIND1P05546 499 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDT7P0C024 238 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 PRKAR1AP10644 381 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 HRH2P25021 359 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 GCAP28676 217 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 RORAP35398 523 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1D4P47884 311 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPA7P48741 367 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 HNMTP50135 292 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SERPINB8P50452 374 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 CCR8P51685 355 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 CSNK1G2P78368 415 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 DCDP81605 110 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 CDKL1Q00532 357 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 GRM7Q14831 915 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC9A5Q14940 896 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 NAA25Q14CX7 972 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ACAP2Q15057 778 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 HKDC1Q2TB90 917 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF44Q7L0R7 432 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 NEIL2Q969S2 332 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SCYL1Q96KG9 808 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 LRFN5Q96NI6 719 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2A5Q96R48 311 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 OR4K3Q96R72 315 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC77Q9BR77 488 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 CUTCQ9NTM9 273 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 WWOXQ9NZC7 414 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 TBK1Q9UHD2 729 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 KCND3Q9UK17 655 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-211ENST00000588374 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms