RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCM1Q15154 2024 aa27.42■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRSS38A1L453 326 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGEB17A8MXT2 336 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 C8BP07358 591 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 DGKEP52429 567 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 FZD5Q13467 585 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 NANOGP8Q6NSW7 305 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMPDL3AQ92484 453 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 NANOGQ9H9S0 305 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLAGL1Q9UM63 463 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNK6Q9Y257 313 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIPSLA2A3N6 862 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 TACR1P25103 407 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 YBX1P67809 324 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 UAP1L1Q3KQV9 507 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPANXN4Q5MJ08 99 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q6ZS52 159 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHTF18Q8WVB6 975 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 GTF2H4Q92759 462 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZUFSPQ96AP4 578 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 C12orf66Q96MD2 445 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR2M4Q96R27 311 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCDHAC1Q9H158 963 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 MUC13Q9H3R2 512 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 MVB12BQ9H7P6 319 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPSM3Q9Y4H4 160 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa27.41■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 TECTAO75443 2155 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 TOR1BO14657 336 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 TNFRSF10CO14798 259 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIK3CBP42338 1070 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLDN2P57739 230 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYT13Q7L8C5 426 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM129CQ86XR2 697 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJB14Q8TBM8 379 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 NUDT8Q8WV74 236 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 HMGB4Q8WW32 186 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR92Q96MX6 357 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYOCQ99972 504 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 PELI2Q9HAT8 420 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 NMRK1Q9NWW6 199 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa27.4■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 BAG2O95816 211 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 YPEL5P62699 121 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACSM2AQ08AH3 577 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 FXNQ16595 210 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPIN4Q56A73 249 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACSM2BQ68CK6 577 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 GALNT18Q6P9A2 607 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB42Q8N4Z0 105 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 FERD3LQ96RJ6 166 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 CGREF1Q99674 301 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 WASH6PQ9NQA3 447 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa27.39■■□□□ 1.98
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 DNAJA2O60884 412 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNH1O95259 989 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 ETHE1O95571 254 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEMA4FO95754 770 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCNAP12004 261 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRPS1L1P21108 318 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 RHDQ02161 417 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLCA4Q14CN2 919 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAPKAPK3Q16644 382 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 DPY19L1Q2PZI1 675 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 WASH2PQ6VEQ5 465 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 ABHD11Q8NFV4 315 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR8J3Q8NGG0 315 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLDN23Q96B33 292 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 CAMK1GQ96NX5 476 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSSK3Q96PN8 268 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1W2PPV9 198 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYO1DO94832 1006 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 DCNP07585 359 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKT2P31751 481 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCR5P51681 352 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 RABL3Q5HYI8 236 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADNP2Q6IQ32 1131 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 C17orf64Q86WR6 236 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 DHFR2Q86XF0 187 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM145Q8NBT3 493 aa27.38■■□□□ 1.97
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLHC1Q8NHS4 586 aa27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms