RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562298.1

VPS9D1-AS1-201, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VPS9D1-AS1, Length 931 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SLC16A8O95907 504 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SERPINA7P05543 415 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 STSP08842 583 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 EZRP15311 586 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TNFSF10P50591 281 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TDGF1P3P51864 188 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PNLIPRP1P54315 467 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SYT16Q17RD7 645 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 REXO1L1PQ8IX06 675 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BCORP1Q8N888 145 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GIMAP7Q8NHV1 300 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF480Q8WV37 535 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MED16Q9Y2X0 877 aa15.86■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CSMD2Q7Z408 3487 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 E5RI56 91 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 E7ENX8 843 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 JRKO75564 520 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 F10P00742 488 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CATP04040 527 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FDXRP22570 491 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PER3P56645 1201 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TAP2Q03519 686 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CUL1Q13616 776 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NEPROQ6NW34 567 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FJX1Q86VR8 437 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HAS2Q92819 552 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DRC3Q9H069 523 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.85■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DYTNA2CJ06 578 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HAT1O14929 419 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 BMP10O95393 424 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HEXBP07686 556 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CXCR2P25025 360 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HSD17B2P37059 387 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAGEA6P43360 314 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 VPS41P49754 854 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RELAQ04206 551 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCOLCEQ15113 449 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF549Q6P9A3 640 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TMEM205Q6UW68 189 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NEK10Q6ZWH5 1172 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PLD3Q8IV08 490 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SHISA5Q8N114 240 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PRELID2Q8N945 189 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 MAIP1Q8WWC4 291 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF700Q9H0M5 742 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 APCP25054 2843 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.84■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.83■□□□□ 0.13
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 TRAV17A0A0B4J275 112 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ENO4A6NNW6 628 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF839A8K0R7 811 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 SMAPO00193 183 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PCDH17O14917 1159 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CCNDBP1O95273 360 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ANXA5P08758 320 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ITGAMP11215 1152 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 PAMP19021 973 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CXCR5P32302 372 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 KCNK10P57789 538 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CTBP1Q13363 440 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 INAQ16352 499 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ARMC3Q5W041 872 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 CASC4Q6P4E1 433 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ADCK2Q7Z695 626 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ASB11Q8WXH4 323 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 NR4A3Q92570 626 aa15.83■□□□□ 0.12
VPS9D1-AS1-201ENST00000562298 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms