RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C1QTNF9P0C862 333 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TAC1P20366 129 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCR8P51685 355 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITGA1P56199 1179 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDK4Q16654 411 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SNX31Q8N9S9 440 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RUFY1Q96T51 708 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SENP1Q9P0U3 644 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SERTAD3Q9UJW9 196 aa22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 K7EPI3 171 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STX16O14662 325 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GNAZP19086 355 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CD82P27701 267 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC153Q494R4 210 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CATSPEREQ5SY80 951 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BANPQ8N9N5 519 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PHF21BQ96EK2 531 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PGM2Q96G03 612 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SMC6Q96SB8 1091 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CENPHQ9H3R5 247 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ACSL6Q9UKU0 697 aa22.98■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHD8Q9HCK8 2581 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A8MT66 165 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 E7EQ34 232 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 H3BMH7 237 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLGNO14967 610 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR2B3O76000 313 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TIAF1O95411 115 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PROCP04070 461 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRK3P35626 688 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NFKB2Q00653 900 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPR135Q8IZ08 494 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB9Q96C00 473 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF285Q96NJ3 590 aa22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLIN3O60664 434 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SCRG1O75711 98 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAPNS1P04632 268 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CTSBP07858 339 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCTE1Q5JU00 501 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM126BQ8IUX1 230 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLD3Q8IV08 490 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR2A5Q96R48 311 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.96■■□□□ 1.27
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STK17BO94768 372 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIAA0754O94854 1291 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYZAPP0CAP1 466 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EPB42P16452 691 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF28P17035 718 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EPORP19235 508 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 REEP5Q00765 189 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATG9BQ674R7 924 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TEX9Q8N6V9 391 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGF11Q92914 225 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 THAP11Q96EK4 314 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SARGQ9BW04 601 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPRY4Q9C004 299 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EHD1Q9H4M9 534 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa22.95■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IGF2RP11717 2491 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRBC2A0A5B9 178 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FEZF1A0PJY2 475 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 H0YGG7 62 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms