RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDH15Q96QU1 1955 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIPSLA2A3N6 862 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR6C74A6NCV1 312 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 BTN3A3O00478 584 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 CBX6O95503 412 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALPPL2P10696 532 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMPK1P30085 196 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCR8P51685 355 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 STX1BP61266 288 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLA2G2CQ5R387 149 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 OGFOD3Q6PK18 319 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF165Q6ZSG1 346 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHSY3Q70JA7 882 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF175Q8N4F7 328 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 SAP25Q8TEE9 199 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR34Q96EX3 536 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf50Q9BV19 199 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL21RQ9HBE5 538 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.59■□□□□ 0.25
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSAPA4D1B5 854 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 LSM1O15116 133 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOBOXO60393 691 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEC22BO75396 215 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCNDBP1O95273 360 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENGP17813 658 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CXCR2P25025 360 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FASLGP48023 281 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 BNIP1Q12981 228 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLF10Q13118 480 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 E2F2Q14209 437 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS6KA2Q15349 733 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPATA19Q7Z5L4 167 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GATAD2AQ86YP4 633 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TREML1Q86YW5 311 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARL14Q8N4G2 192 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUMF1Q8NBK3 374 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBE2E3Q969T4 207 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACPTQ9BZG2 426 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPNS1Q9H2V7 528 aa16.58■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRR35P0CG20 571 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERVK-8P63133 956 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABATP80404 500 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT72Q14CN4 511 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPRED3Q2MJR0 410 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 C14orf28Q4W4Y0 310 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM91A1Q658Y4 838 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARL10Q8N8L6 244 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR156Q8NFN8 814 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2L3Q8NG85 312 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 HUS1BQ8NHY5 278 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCEAL3Q969E4 200 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NSL1Q96IY1 281 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRTM1Q9HBL6 345 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCL27Q9Y4X3 112 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDFY4Q6ZS81 3184 aa16.57■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAPN14A8MX76 684 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SH3BGRLO75368 114 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHEXP78562 749 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF33BQ06732 778 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SQLEQ14534 574 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIR2DS3Q14952 304 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADNP2Q6IQ32 1131 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OGFOD2Q6N063 350 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms