RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	CALCOCO2	Q13137	446 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NAA25	Q14CX7	972 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MORF4L2	Q15014	288 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SYTL3	Q4VX76	610 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ATG9B	Q674R7	924 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DUPD1	Q68J44	220 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	COX15	Q7KZN9	410 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PCGF5	Q86SE9	256 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KRT222	Q8N1A0	295 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MCU	Q8NE86	351 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MNS1	Q8NEH6	495 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR4L1	Q8NH43	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ELMO1	Q92556	727 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MIEF2	Q96C03	454 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	C14orf79	Q96F83	325 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CCDC120	Q96HB5	630 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CRB3	Q9BUF7	120 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	IL22	Q9GZX6	179 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RNF32	Q9H0A6	362 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RAB17	Q9H0T7	212 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TREX1	Q9NSU2	369 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SEC16A	O15027	2179 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HYKK	A2RU49	373 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ALOX12B	O75342	701 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	WFS1	O76024	890 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	UNC5C	O95185	931 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	BMP10	O95393	424 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CTSB	P07858	339 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PRR35	P0CG20	571 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PGAM1	P18669	254 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PSMA3	P25788	255 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PKLR	P30613	574 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SOX11	P35716	441 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MAGEA3	P43357	314 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR1D4	P47884	311 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PGGT1B	P53609	377 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	EMP3	P54852	163 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ARL4C	P56559	192 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CDK16	Q00536	496 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KLC1	Q07866	573 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688		Q0VFX4	171 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CTBP1	Q13363	440 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CRYM	Q14894	314 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LONRF1	Q17RB8	773 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MUM1	Q2TAK8	710 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TTC23L	Q6PF05	361 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CEP112	Q8N8E3	955 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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