RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	TRIM4	Q9C037	500 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	WHRN	Q9P202	907 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FAM187A	A6NFU0	413 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SOCS6	O14544	535 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PCDH17	O14917	1159 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SLC26A3	P40879	764 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	OR1D4	P47884	311 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MGAT5	Q09328	741 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	DUPD1	Q68J44	220 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	GALNT16	Q8N428	558 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CFAP36	Q96G28	342 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	VPS50	Q96JG6	964 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	SARG	Q9BW04	601 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CTSF	Q9UBX1	484 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.94	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137		H7BY64	318 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	10.93	□□□□□ -0.66	2e-6	■■■■□ 21.8
CS-223	ENST00000551137	FOXS1	O43638	330 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ALPP	P05187	535 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	NPPB	P16860	134 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HIST1H2AD	P20671	130 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FOXL2	P58012	376 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TBPL1	P62380	186 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	OCA2	Q04671	838 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PHKG1	Q16816	387 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HKDC1	Q2TB90	917 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ATG9B	Q674R7	924 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	LCTL	Q6UWM7	567 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	OR56A3	Q8NH54	315 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	LINGO1	Q96FE5	620 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	OLFM1	Q99784	485 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	10.93	□□□□□ -0.66
CS-223	ENST00000551137	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66

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