RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 MZB1Q8WU39 189 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PTERQ96BW5 349 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TCTN2Q96GX1 697 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CNDP1Q96KN2 507 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CMKLR1Q99788 373 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SH3GL2Q99962 352 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 XKR8Q9H6D3 395 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ACTR8Q9H981 624 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 EURLQ9NYK6 297 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 COPG2Q9UBF2 871 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ICKQ9UPZ9 632 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TMEM131Q92545 1883 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 A0A088AWK7 358 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TARM1B6A8C7 271 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 KLK10O43240 276 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 UGDHO60701 494 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 HSPA4LO95757 839 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PROCP04070 461 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 GSTM2P28161 218 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 IMPA1P29218 277 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 GGT5P36269 586 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CCR10P46092 362 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 HSPA7P48741 367 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 INHBCP55103 352 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 DNAJB13P59910 316 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CCL7P80098 99 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 HSD11B2P80365 405 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ACY1Q03154 408 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 IFT88Q13099 833 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SQSTM1Q13501 440 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 GTF2H2Q13888 395 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.929e-14■■■□□ 15.6
CS-218ENST00000550159 PHKG1Q16816 387 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 XKR6Q5GH73 641 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ICE2Q659A1 982 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 C16orf46Q6P387 395 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 USP53Q70EK8 1073 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 AGBL5Q8NDL9 886 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 OR8K5Q8NH50 307 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 OR56A3Q8NH54 315 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ZNF480Q8WV37 535 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TLCD1Q96CP7 247 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 THAP11Q96EK4 314 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 KLHL3Q9UH77 587 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TAC3Q9UHF0 121 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SNX6Q9UNH7 406 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ST14Q9Y5Y6 855 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 TMEM114B3SHH9 223 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 D6RAR5 112 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 E7ENX8 843 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 CLDN9O95484 217 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 KRT6AP02538 564 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 KRT6BP04259 564 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 JMJD7P0C870 316 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 ERGP11308 486 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 UGT2B7P16662 529 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 HMOX2P30519 316 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 HNF4AP41235 474 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 SERPINB4P48594 390 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 KRT6CP48668 564 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 ACADVLP49748 655 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 PKNOX1P55347 436 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 TAP2Q03519 686 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-218ENST00000550159 RGS1Q08116 209 aa9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms