RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	SPP1	P10451	314 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	P4HA1	P13674	534 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	EPCAM	P16422	314 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GM2A	P17900	193 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CBL	P22681	906 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHX2	P34913	555 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MFAP3	P55082	362 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CLDN15	P56746	228 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1024L	P59773	190 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NPRL3	Q12980	569 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	VEZF1	Q14119	521 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PPA1	Q15181	289 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS6KA1	Q15418	735 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SUSD4	Q5VX71	490 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SATL1	Q86VE3	508 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FJX1	Q86VR8	437 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	COMMD2	Q86X83	199 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM219	Q86XT9	240 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PTOV1	Q86YD1	416 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF128	Q8TEB7	428 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CENPT	Q96BT3	561 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DHX58	Q96C10	678 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	POT1	Q9NUX5	634 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SIX4	Q9UIU6	781 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	INSR	P06213	1382 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1W2PPW3	197 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNHIT1	O43257	154 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP6AP2	O75787	350 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GH1	P01241	217 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LIPF	P07098	398 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KRT19	P08727	400 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM106CP	P0CH98	169 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HLA-DOB	P13765	273 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF12	P17014	697 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ALDH1B1	P30837	517 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ARRB2	P32121	409 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PCYT1A	P49585	367 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC12A3	P55017	1021 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	IL1RL1	Q01638	556 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FOLH1	Q04609	750 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	WASHC5	Q12768	1159 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MYBPH	Q13203	477 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ITPK1	Q13572	414 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NPTX1	Q15818	432 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SGCB	Q16585	318 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CA9	Q16790	459 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CASC4	Q6P4E1	433 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LINGO4	Q6UY18	593 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SMIM5	Q71RC9	77 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PIM3	Q86V86	326 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GPC2	Q8N158	579 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	AMER3	Q8N944	861 aa		3.84	□□□□□ -1.79

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