RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 SCN2BO60939 215 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PRAMEF1O95521 474 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 C1QAP02745 245 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 RAP2AP10114 183 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 EPCAMP16422 314 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 STOMP27105 288 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ELK4P28324 431 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 PON3Q15166 354 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 KLHL26Q53HC5 615 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 ANKFN1Q8N957 763 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 ASB15Q8WXK1 588 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRD-214ENST00000540109 PTERQ96BW5 349 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRD-214ENST00000540109 M0R036 132 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PLOD2O00469 737 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RGS14O43566 566 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 TOXO94900 526 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RLN1P04808 185 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 FGFBP1Q14512 234 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 HMGN3Q15651 99 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PARP15Q460N3 678 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 L7N2F9 121 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 JUPP14923 745 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 CDK20Q8IZL9 346 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 COL21A1Q96P44 957 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TYRP14679 529 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PCSK6P29122 969 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 RPL4P36578 427 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 GRIA4P48058 902 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 DGKQP52824 942 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CXCR4P61073 352 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
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