RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 OR10A6Q8NH74 314 aa9.21□□□□□ -0.93
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PTPRB-204ENST00000538708 P04436 131 aa9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
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PTPRB-204ENST00000538708 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF100Q8IYN0 542 aa9.2□□□□□ -0.94
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