RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536854.6

PRKAR1A-204, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 3,697 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-204ENST00000536854 HDAC3O15379 428 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 UGDHO60701 494 aa6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 TSPAN12O95859 305 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 JUPP14923 745 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 MAGP20916 626 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 CYHR1Q6ZMK1 362 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 SPATA21Q7Z572 469 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 FRG2BQ96QU4 278 aa6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 OR1D5P58170 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 TCTE1Q5JU00 501 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.5□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 ABHD13Q7L211 337 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 STARD8Q92502 1023 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 RSC1A1Q92681 617 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 THAP11Q96EK4 314 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 PCDHGB4Q9UN71 923 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 TRIM38O00635 465 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 KLF11O14901 512 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 NDUFS4O43181 175 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 SH3BGRLO75368 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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PRKAR1A-204ENST00000536854 AQP5P55064 265 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 SHC2P98077 582 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 DOC2AQ14183 400 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 GBX1Q14549 363 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 MAPRE2Q15555 327 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 MUM1Q2TAK8 710 aa6.49□□□□□ -1.37
PRKAR1A-204ENST00000536854 UNC50Q53HI1 259 aa6.49□□□□□ -1.37
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