RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 RAB10P61026 200 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 RPS18P62269 152 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 CSNK1G2P78368 415 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 39.1
PKP3-211ENST00000534401 CDKL4Q5MAI5 379 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 BORAQ6PGQ7 559 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 HAUS8Q9BT25 410 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.4■□□□□ 0.86
PKP3-211ENST00000534401 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 HAT1O14929 419 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 CD63P08962 238 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 PRKAR1AP10644 381 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 CD1DP15813 335 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 PHBP35232 272 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 SLC26A3P40879 764 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 NFKB2Q00653 900 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 ERV3-1Q14264 604 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 FKBP10Q96AY3 582 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 THAP11Q96EK4 314 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 C10orf90Q96M02 699 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 STARD5Q9NSY2 213 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 POLHQ9Y253 713 aa20.39■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.39■□□□□ 0.85
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PKP3-211ENST00000534401 C9J4A7 227 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 ALBP02768 609 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 CCDC166P0CW27 439 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 HNMTP50135 292 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 ATP6V0D1P61421 351 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 IL10RAQ13651 578 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 C1orf189Q5VU69 101 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 C16orf46Q6P387 395 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 COX15Q7KZN9 410 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 OVCH1Q7RTY7 1134 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 C17orf64Q86WR6 236 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 IFT20Q8IY31 132 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TM4SF19Q96DZ7 209 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 MED8Q96G25 268 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.38■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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PKP3-211ENST00000534401 C1QL1O75973 258 aa20.37■□□□□ 0.85
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PKP3-211ENST00000534401 ANXA5P08758 320 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 CRABP2P29373 138 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 GGT5P36269 586 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 SLC6A12P48065 614 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 DLG1Q12959 904 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TGFBIQ15582 683 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 VN1R4Q7Z5H5 301 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 THAP4Q8WY91 577 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 KIAA1191Q96A73 305 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 PTERQ96BW5 349 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 PYCR2Q96C36 320 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 RHBDF1Q96CC6 855 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.37■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 NFU1Q9UMS0 254 aa20.37■□□□□ 0.85
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PKP3-211ENST00000534401 LY6DQ14210 128 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 SLMAPQ14BN4 828 aa20.36■□□□□ 0.85
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PKP3-211ENST00000534401 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 ISL2Q96A47 359 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 MVB12AQ96EY5 273 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 WDR54Q9H977 334 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 FASNP49327 2511 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 PCSK5Q92824 1860 aa20.36■□□□□ 0.85
PKP3-211ENST00000534401 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa20.35■□□□□ 0.85
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