RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530267.5

USP35-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 35, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP35, Length 2,419 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35-204ENST00000530267 ELP6Q0PNE2 266 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TMIEQ8NEW7 156 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SUSD6Q92537 303 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 NELL1Q92832 810 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 IL17FQ96PD4 163 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 PCM1Q15154 2024 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 G3V2T6 193 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 PSMD11O00231 422 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 P2RY2P41231 377 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 GZMMP51124 257 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CES5AQ6NT32 575 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TERB1Q8NA31 727 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 HAUS8Q9BT25 410 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TRIOO75962 3097 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 H0YIV9 168 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CLIC1O00299 241 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SCELO95171 688 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ALBP02768 609 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 RB1P06400 928 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 PBX2P40425 430 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 HNF4AP41235 474 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CASP9P55211 416 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CNTN1Q12860 1018 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SPIDRQ14159 915 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 IER5LQ5T953 404 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SPESP1Q6UW49 350 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 GPR149Q86SP6 731 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CALHM3Q86XJ0 350 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 PPP1R16AQ96I34 528 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TMEM245Q9H330 911 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ZNF639Q9UID6 485 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TGFB1P01137 390 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 NPPBP16860 134 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 WNT3P56703 355 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 GTF2H3Q13889 308 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 XKR5Q6UX68 686 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 MUS81Q96NY9 551 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.63□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 GABRR3A8MPY1 467 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 EVPLLA8MZ36 301 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 MYO1DO94832 1006 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 NTRK1P04629 796 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 PCCBP05166 539 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ALDH3A2P51648 485 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 MAP7Q14244 749 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 LAPTM4AQ15012 233 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 OR51B5Q9H339 312 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 DNAJB9Q9UBS3 223 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 VPS4AQ9UN37 437 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ASF1AQ9Y294 204 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 B4GAT1O43505 415 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 E2F6O75461 281 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 ALPLP05186 524 aa14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP35-204ENST00000530267 MTAPQ13126 283 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms