RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDH7Q9ULB5 785 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NUMA1Q14980 2115 aa6.55□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PTPRSQ13332 1948 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NOTCH4Q99466 2003 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRIM64BA6NI03 449 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SOCS2O14508 198 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ABCB7O75027 752 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 JRKO75564 520 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CSPG5O95196 566 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C1orf105O95561 183 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SMIM18P0DKX4 95 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COX7A2P14406 83 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DRD2P14416 443 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SDC1P18827 310 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 C5AR1P21730 350 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PAX7P23759 505 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KDELR2P33947 212 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PCGF2P35227 344 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GZMMP51124 257 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERVFC1P60507 584 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ERVK-21P61565 698 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ABATP80404 500 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPP2R2BQ00005 443 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TGM3Q08188 693 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DOC2AQ14183 400 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RABL3Q5HYI8 236 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IYDQ6PHW0 289 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF773Q6PK81 442 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 Q6ZVL8 140 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AMZ2Q86W34 360 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GJD3Q8N144 294 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SVOPQ8N4V2 548 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OR7G3Q8NG95 312 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 OR2T29Q8NH02 315 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SMPDL3AQ92484 453 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SNX19Q92543 992 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FIG4Q92562 907 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VOPP1Q96AW1 172 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COX14Q96I36 57 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VPS50Q96JG6 964 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TEX37Q96LM6 180 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PPM1MQ96MI6 270 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC29A1Q99808 456 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PSD2Q9BQI7 771 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TMEM245Q9H330 911 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 REEP4Q9H6H4 257 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SGK2Q9HBY8 427 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SERHLQ9NQF3 203 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EHD3Q9NZN3 535 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VAPAQ9P0L0 249 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.54□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC160A6NGH7 325 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EI24O14681 340 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FPGTO14772 594 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SUV39H1O43463 412 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms