RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525528.1

BDNF-212, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene BDNF, Length 4,766 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-212ENST00000525528 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 A8MVJ9 347 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 PDLIM1O00151 329 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 HAS3O00219 553 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 NRP2O60462 931 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 PSMG1O95456 288 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 CPNE6O95741 557 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 CYP11A1P05108 521 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ZNF35P13682 527 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ADAM8P78325 824 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TGFBR3Q03167 851 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TDGQ13569 410 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 SPIN4Q56A73 249 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TMEM17Q86X19 198 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 SFRP1Q8N474 314 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 PRELID2Q8N945 189 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 RNF39Q9H2S5 420 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 IFT46Q9NQC8 304 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 HPF1Q9NWY4 346 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 GIN1Q9NXP7 522 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 GADD45AP24522 165 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TAS2R40P59535 323 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ZNF844Q08AG5 666 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 RAB33AQ14088 237 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 RAET1LQ5VY80 246 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ZNF567Q8N184 647 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ASB15Q8WXK1 588 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 PIK3R3Q92569 461 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 P2RX2Q9UBL9 471 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 A0A1W2PRG6 482 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 DHRS12A0PJE2 317 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TNFRSF11BO00300 401 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 PDCD5O14737 125 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 GNB5O14775 395 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 FANCGO15287 622 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 MPZL2O60487 215 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 UGT2B11O75310 529 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 MTX2O75431 263 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 GJB5O95377 273 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 RLN1P04808 185 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 PRKCGP05129 697 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 PRPS1L1P21108 318 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 ADSSP30520 456 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 MAP3K8P41279 467 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 IL12RB1P42701 662 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 BST1Q10588 318 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 LRP8Q14114 963 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 SEMA3AQ14563 771 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 MED22Q15528 200 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 IFI44LQ53G44 452 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 C17orf99Q6UX52 265 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 Q6ZVL8 140 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 MSANTD3Q96H12 275 aa6.85□□□□□ -1.31
BDNF-212ENST00000525528 TMEM68Q96MH6 324 aa6.85□□□□□ -1.31
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