RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 LAPTM5Q13571 262 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GTF2H2Q13888 395 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TBCCQ15814 346 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZIC1Q15915 447 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ATG9BQ674R7 924 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CEACAM20Q6UY09 585 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FAM20CQ8IXL6 584 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 OR4K1Q8NGD4 311 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ESAMQ96AP7 390 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 WDR34Q96EX3 536 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 AIF1LQ9BQI0 150 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 OXSMQ9NWU1 459 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PCTPQ9UKL6 214 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 KLK13Q9UKR3 277 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 RARRES3Q9UL19 164 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SPEGQ15772 3267 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 H7BY64 318 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SASH3O75995 380 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CREB1P16220 341 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GABREP78334 506 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CSNK1G2P78368 415 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FOXM1Q08050 763 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CAMK2BQ13554 666 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 E2F2Q14209 437 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 RTP5Q14D33 572 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FBXO48Q5FWF7 155 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PAGE2BQ5JRK9 111 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TCTE1Q5JU00 501 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 LIPMQ5VYY2 423 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 NXPE4Q6UWF7 544 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TEX9Q8N6V9 391 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PPP4R1Q8TF05 950 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SEC16BQ96JE7 1060 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PRAP1Q96NZ9 151 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 OR6C1Q96RD1 312 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TAAR9Q96RI9 348 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 KLHL25Q9H0H3 589 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ENAMQ9NRM1 1142 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF446Q9NWS9 450 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 OCIAD1Q9NX40 245 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PISDQ9UG56 409 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SH2B3Q9UQQ2 575 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ASB1Q9Y576 335 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TRBC2A0A5B9 178 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 E7EQ34 232 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 H3BQF6 201 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 DXOO77932 396 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FGF5P12034 268 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CASP2P42575 452 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ETV4P43268 484 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GABRA4P48169 554 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PCLAFQ15004 111 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF678Q5SXM1 525 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 DCAF12Q5T6F0 453 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R3BQ86XI6 285 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 GPR135Q8IZ08 494 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 KRT78Q8N1N4 520 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM237Q96Q45 408 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FAM60AQ9NP50 221 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 KCNK9Q9NPC2 374 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SLC39A1Q9NY26 324 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SLC17A7Q9P2U7 560 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SERTAD3Q9UJW9 196 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 PILRAQ9UKJ1 303 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 KLHL20Q9Y2M5 609 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TXNDC9O14530 226 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 FOLR1P15328 257 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ITGA1P56199 1179 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 YBX1P67809 324 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 SH3BP2P78314 561 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 REEP5Q00765 189 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 IRF8Q02556 426 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 XKR6Q5GH73 641 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 HOMEZQ8IX15 550 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TTLQ8NG68 377 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 UBE2E3Q969T4 207 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 IPPKQ9H8X2 491 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM120BA0PK00 339 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM150CB9EJG8 249 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRK-218ENST00000525459 CTSVO60911 334 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86 ms