RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 GIPC1O14908 333 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 HAT1O14929 419 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN9O95484 217 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPN1P07384 714 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC24CP53992 1094 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC5A12Q1EHB4 618 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 SGO1Q5FBB7 561 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 FIGLAQ6QHK4 219 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 PLXDC1Q8IUK5 500 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD11Q8NFV4 315 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 NTMT1Q9BV86 223 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM60AQ9NP50 221 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa21.84■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 HCRTR1O43613 425 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 ESRRBO95718 433 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CPNE6O95741 557 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CCR8P51685 355 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 NEK2P51955 445 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP4F3Q08477 520 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 ATG9BQ674R7 924 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM129CQ86XR2 697 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 TRMOQ9BU70 441 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 EPHA6Q9UF33 1036 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM21Q9UKJ8 722 aa21.83■■□□□ 1.09
TSNARE1-208ENST00000524325 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CTSVO60911 334 aa21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ABATP80404 500 aa21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNAB1Q14722 419 aa21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC34Q8IZ02 419 aa21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 EPB41L1Q9H4G0 881 aa21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CRCPO75575 148 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CCNDBP1O95273 360 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 EBLN1P0CF75 366 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LSP1P33241 339 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 HTR6P50406 440 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 DEFB110Q30KQ9 67 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF425Q6IV72 752 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM71Q6P5X7 295 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RGS9BPQ6ZS82 235 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 METTL6Q8TCB7 284 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MACROD1Q9BQ69 325 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 BTRCQ9Y297 605 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAF6Q9Y4K3 522 aa21.82■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MATN2O00339 956 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZW10O43264 779 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SH3BGRLO75368 114 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 C9P02748 559 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 JUNP05412 331 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CTSBP07858 339 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPINB5P36952 375 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LIMK1P53667 647 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP4F2P78329 520 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PAQR7Q86WK9 346 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB33BQ9H082 229 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 UNC13CQ8NB66 2214 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A0J9YVX5 310 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TLCD2A6NGC4 264 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1F1O43749 312 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 GP1BAP07359 652 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PCNAP12004 261 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 HGFP14210 728 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PKNOX1P55347 436 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SPIDRQ14159 915 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO42Q6P3S6 717 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 DHRS13Q6UX07 377 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4K1Q8NGD4 311 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM107BQ9H098 131 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 C1GALT1Q9NS00 363 aa21.81■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 D6RAR5 112 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TM4SF5O14894 197 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 AZIN1O14977 448 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms