RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	IDI2	Q9BXS1	227 aa		3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	DAPK1	P53355	1430 aa		3.78	□□□□□ -1.8
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		3.78	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A087WZY1	265 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0B4J203	849 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HYKK	A2RU49	373 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		F8WDY8	70 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SGK1	O00141	431 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDN3	O15551	220 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNN4	O15554	427 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10H2	O60403	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MTX2	O75431	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PGK2	P07205	417 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FGF2	P09038	288 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	EPCAM	P16422	314 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CHRNB2	P17787	502 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	UGT1A1	P22309	533 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJB1	P25685	340 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A12	P48065	614 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CTSC	P53634	463 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDN20	P56880	219 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP1	Q07960	439 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CHIT1	Q13231	466 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RIPK1	Q13546	671 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	STXBP2	Q15833	593 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CARTPT	Q16568	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	USH1G	Q495M9	461 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GAGE2E	Q4V326	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	C18orf63	Q68DL7	685 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	LCN10	Q6JVE6	187 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ASPG	Q86U10	573 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PIM3	Q86V86	326 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD46	Q86W74	232 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NRROS	Q86YC3	692 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF573	Q86YE8	665 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	AMER3	Q8N944	861 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX45	Q8NA69	505 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	OR4A16	Q8NH70	328 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SMPDL3B	Q92485	455 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FCGR1B	Q92637	280 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC25	Q96NG3	672 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC22A12	Q96S37	553 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RAD9A	Q99638	391 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CMKLR1	Q99788	373 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SSX3	Q99909	188 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ACPT	Q9BZG2	426 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		Q9N2K0	584 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MIOS	Q9NXC5	875 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TINAG	Q9UJW2	476 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PADI3	Q9ULW8	664 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NME7	Q9Y5B8	376 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		3.77	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPKBP1	O60336	1514 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GAGE12J	A6NER3	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS46	E5RG02	174 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		H3BNX3	289 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM178B	H3BS89	294 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TIMM23	O14925	209 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ITM2A	O43736	263 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CYTIP	O60759	359 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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